今まで使用していた旧善通寺偕行社は、重要文化財建造物に指定されました。そのため、現在郷土館の機能は赤門筋に移動しました。市内の古墳から出土した考古資料を中心に、市の歴史と民俗を紹介しています。市内は讃岐古代文化発祥の地として知られ、数多くの資料が発掘され、保存されています。