開山は約１４００年前、羽黒山も山自体が御神体でしたが後に頂上の池が信仰の中心となり、さらに後には仏教の影響から社殿を中心とした信仰とかわりました。古い書に「羽黒神社」と書いて「いけのみたま」と読ませているのは昔の名残です。また羽黒山には三山（月山、羽黒山、湯殿山）の神を合祭した出羽神社があります。