島原城天守閣にある史料館です。南蛮貿易を盛んに行ったキリシタン大名・有馬晴信時代の華やかな文物に始まり、宣教時代・禁教時代・弾圧時代と続きます。隠れキリシタン関連の資料は有名で貴重なものが多く見られます。島原の乱関連の資料のほか、歴代藩主や島原城関連の郷土史料も展示されています。