熊本の総鎮守として古くから信仰を集めている神社です。応神天皇を主祭神とし、神功皇后・住吉三神を相殿に祀っています。西南戦争で焼失した社殿も復興され、大正４年には国幣小社に列格されています。熊本の代表的な秋祭り、藤崎八旙宮秋期例大祭で有名です。