おがの化石館は、秩父ジオパークの見どころの一つ「ようばけ」を見渡す場所にあります。「ようばけ」は、高さ約１００ｍ、幅約４００ｍに及ぶ、今から１，５００万年前に堆積した地層の大露頭で、宮沢賢治も調査に訪れています。おがの化石館では、ようばけと同じ地層で発見されたパレオパラドキシアの骨格模型をはじめ、小鹿野で採取した化石はもちろん、日本・世界の化石を展示しています。