約１１５０年前の貞観元年（859年）に大分県宇佐神宮より国の護り神として歓請され、都の裏鬼門である男山に鎮座されました。現社殿は、織田信長や豊臣秀吉・秀頼の修理再建を経て徳川家光により造営されており、２０１６年２月９日に本社１０棟 附棟札３枚が国宝に指定されました。
２月４日～１２月３１日の１１時と１４時に行われる昇殿参拝では、神職が社殿内を案内し、織田信長奉納の黄金の雨どいなどを見ることができます（初穂料1,000円。但し、挙式や祭典神事などにより案内できない場合もあります。）